Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIFAP3Q92845 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFAP3Q92845 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms