Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC4Q8TBB5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms