Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM3Q8NE01 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM3Q8NE01 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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