Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN4CLQ8ND94 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN4CLQ8ND94 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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