Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBOF1Q8ND07 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOF1Q8ND07 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms