Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNTD1Q8N9Z9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD1Q8N9Z9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms