Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms