Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms