Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPM2Q86SE8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms