Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNI2Q6ZMN8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms