Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms