Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 COMMD1-205ENST00000455659 388 ntTSL 36.1□□□□□ -1.432e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 ETV5-209ENST00000475484 472 ntTSL 35.97□□□□□ -1.452e-9■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 MTRR-225ENST00000514369 779 ntTSL 55.94□□□□□ -1.462e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 SFI1-218ENST00000467357 372 ntTSL 35.67□□□□□ -1.52e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 RSPRY1-212ENST00000568920 551 ntTSL 45.39□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 PTPN4-209ENST00000469511 476 ntTSL 34.95□□□□□ -1.622e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 TCTN1-211ENST00000481093 685 ntTSL 24.88□□□□□ -1.632e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 MRPS22-211ENST00000492644 2160 ntTSL 1 (best)4.85□□□□□ -1.632e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.662e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 PTPN4-206ENST00000441089 671 ntTSL 34.64□□□□□ -1.672e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 DROSHA-210ENST00000510178 379 ntTSL 54.61□□□□□ -1.675e-24■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 USP8-210ENST00000560379 737 ntTSL 24.6□□□□□ -1.672e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-213ENST00000488877 924 ntTSL 1 (best)4.52□□□□□ -1.692e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-214ENST00000492756 836 ntTSL 1 (best)4.52□□□□□ -1.692e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.692e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-215ENST00000494410 975 ntTSL 1 (best)4.52□□□□□ -1.692e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.712e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 CAAP1-204ENST00000517946 379 ntTSL 54.22□□□□□ -1.732e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 DROSHA-203ENST00000504133 617 ntTSL 34.15□□□□□ -1.755e-24■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.792e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-216ENST00000494799 681 ntTSL 33.59□□□□□ -1.832e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.872e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 TCTN1-222ENST00000549123 458 ntTSL 23.34□□□□□ -1.872e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-220ENST00000640681 2221 ntTSL 53.33□□□□□ -1.882e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 TCTN1-226ENST00000552038 960 ntTSL 23.29□□□□□ -1.882e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-218ENST00000640140 2262 ntTSL 53.27□□□□□ -1.892e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.982e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 SRBD1-205ENST00000493649 655 ntTSL 42.64□□□□□ -1.992e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-210ENST00000479522 857 ntTSL 1 (best)2.26□□□□□ -2.052e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 EIF5B-203ENST00000470868 573 ntTSL 22.08□□□□□ -2.085e-24■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 FAS-212ENST00000487314 824 ntTSL 51.89□□□□□ -2.112e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.131e-8■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.142e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.22e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 CLOCK-205ENST00000506747 1337 ntTSL 1 (best)1.28□□□□□ -2.211e-9■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 CUL3-209ENST00000481135 754 ntTSL 30.63□□□□□ -2.312e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 POLR1B-212ENST00000475318 680 ntTSL 30.21□□□□□ -2.385e-13■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 ATG4C-204ENST00000414558 464 ntTSL 50.09□□□□□ -2.42e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 GTF3C3-209ENST00000466862 447 ntTSL 20.09□□□□□ -2.42e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 SNX16-210ENST00000521810 804 ntTSL 5-0.85□□□□□ -2.552e-12■■■■■ 46.8
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A2-222ENST00000492144 993 ntTSL 24.46□□□□□ -1.692e-11■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A2-216ENST00000468362 1356 ntTSL 24.02□□□□□ -1.772e-11■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 TOPBP1-209ENST00000513818 898 ntTSL 1 (best)8.13□□□□□ -1.113e-13■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 TOPBP1-205ENST00000506779 536 ntTSL 21.5□□□□□ -2.173e-13■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 SLC4A7-205ENST00000428179 3224 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 RSL1D1-212ENST00000574823 576 ntTSL 21□□□□□ -2.251e-11■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 SNX5-216ENST00000494401 656 ntTSL 54.1□□□□□ -1.752e-11■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 TPT1-AS1-218ENST00000523445 856 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 IFFO2-202ENST00000416166 1000 ntTSL 312.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 KIAA1551-202ENST00000381054 2326 ntTSL 5-0.28□□□□□ -2.456e-11■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 GNL3-206ENST00000468885 263 ntTSL 1 (best)5.11□□□□□ -1.598e-8■■■■■ 46.7
PRPF8Q6P2Q9 PPP2R3C-209ENST00000554899 762 ntTSL 30.68□□□□□ -2.31e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.755e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 TMX3-210ENST00000569053 940 ntTSL 1 (best)9.58□□□□□ -0.885e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.25e-7■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 PTPN18-213ENST00000489215 460 ntTSL 420.39■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 PTPN18-205ENST00000428843 785 ntTSL 318.6■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-207ENST00000477299 656 ntTSL 513.25□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-210ENST00000492672 809 ntTSL 413.25□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-214ENST00000577246 639 ntTSL 211.71□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-218ENST00000584216 876 ntTSL 311.71□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-215ENST00000578317 1625 ntTSL 26.48□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-202ENST00000417352 1009 ntTSL 56.02□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-204ENST00000462236 551 ntTSL 54.57□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-213ENST00000577210 752 ntTSL 30.38□□□□□ -2.353e-6■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 RSL24D1-204ENST00000564344 269 ntTSL 510.04□□□□□ -0.89e-12■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 RSL24D1-201ENST00000260443 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.39e-12■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 RSL24D1-203ENST00000562993 940 ntTSL 33.11□□□□□ -1.919e-12■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-226ENST00000488963 517 ntTSL 317.01■□□□□ 0.313e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-204ENST00000433170 560 ntTSL 417.01■□□□□ 0.313e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-202ENST00000420814 884 ntTSL 315.59■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-211ENST00000463738 528 ntTSL 415.59■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-224ENST00000486316 406 ntTSL 415.59■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-228ENST00000492077 731 ntTSL 215.1■□□□□ 0.013e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-203ENST00000430423 753 ntTSL 214.1□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-208ENST00000452882 598 ntTSL 314.1□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-219ENST00000478224 507 ntTSL 314.1□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-206ENST00000449729 678 ntTSL 213.82□□□□□ -0.23e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-221ENST00000482427 556 ntTSL 413.31□□□□□ -0.283e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-217ENST00000474618 566 ntTSL 313.31□□□□□ -0.283e-9■■■■■ 46.6
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.29e-13■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.729e-13■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-208ENST00000481647 576 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.819e-13■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 GPATCH8-201ENST00000335500 8109 ntTSL 27.66□□□□□ -1.182e-43■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 SF3B3-214ENST00000572365 575 ntTSL 44.95□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 P4HB-205ENST00000467086 785 ntTSL 520.01■□□□□ 0.792e-74■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 CRIP2-209ENST00000551738 595 ntTSL 323.26■■□□□ 1.311e-11■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 WRB-203ENST00000380713 768 ntTSL 316.38■□□□□ 0.216e-13■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.046e-13■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.186e-13■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 WRB-214ENST00000623703 1392 ntTSL 211.49□□□□□ -0.576e-13■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 WRB-212ENST00000487869 537 ntTSL 211.31□□□□□ -0.66e-13■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.756e-13■■■■■ 46.5
PRPF8Q6P2Q9 WRB-207ENST00000466787 1416 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.036e-13■■■■■ 46.5
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 525 ms