Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUPD1Q68J44 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms