Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP135Q66GS9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP135Q66GS9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms