Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRCH2Q5VUJ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRCH2Q5VUJ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms