Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GKAP1Q5VSY0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms