Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIF1Q5UIP0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms