Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPECC1Q5M775 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPECC1Q5M775 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPECC1Q5M775 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms