Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFHC1Q5JVL4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHC1Q5JVL4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms