Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF394Q53GI3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF394Q53GI3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms