Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF3Q496Y0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF3Q496Y0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms