Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C18orf21Q32NC0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms