Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGSM1Q2NKQ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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