Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFX7Q2KHR2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX7Q2KHR2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms