Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q1T7F1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q1T7F1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q1T7F1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q1T7F1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q1T7F1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q1T7F1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q1T7F1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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