Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDO1Q16878 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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