Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCAQ16586 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCAQ16586 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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