Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF11Q15544 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF11Q15544 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF11Q15544 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF11Q15544 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF11Q15544 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF11Q15544 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF11Q15544 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF11Q15544 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF11Q15544 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF11Q15544 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF11Q15544 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF11Q15544 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF11Q15544 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF11Q15544 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF11Q15544 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF11Q15544 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF11Q15544 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF11Q15544 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF11Q15544 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms