Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDC1Q14676 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDC1Q14676 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms