Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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