Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBM39Q14498 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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