Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP1A4Q13733 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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