Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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