Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LTBQ06643 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTBQ06643 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBQ06643 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBQ06643 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBQ06643 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBQ06643 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBQ06643 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBQ06643 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBQ06643 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBQ06643 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTBQ06643 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTBQ06643 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTBQ06643 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTBQ06643 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTBQ06643 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTBQ06643 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTBQ06643 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTBQ06643 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTBQ06643 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms