Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEFA5Q01523 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA5Q01523 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms