Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR1P84550 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms