Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11AP62491 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11AP62491 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms