Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOAP61586 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOAP61586 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOAP61586 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOAP61586 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOAP61586 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOAP61586 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOAP61586 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOAP61586 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOAP61586 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOAP61586 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOAP61586 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOAP61586 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOAP61586 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOAP61586 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOAP61586 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOAP61586 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOAP61586 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOAP61586 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOAP61586 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOAP61586 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOAP61586 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOAP61586 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOAP61586 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOAP61586 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOAP61586 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOAP61586 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOAP61586 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOAP61586 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOAP61586 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOAP61586 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOAP61586 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOAP61586 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOAP61586 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms