Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TMEM258P61165 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TMEM258P61165 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TMEM258P61165 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM258P61165 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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