Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFRD-1P60508 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms