Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC4P56524 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms