Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBP50607 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBP50607 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBP50607 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBP50607 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBP50607 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBP50607 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBP50607 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBP50607 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBP50607 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBP50607 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBP50607 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBP50607 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBP50607 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBP50607 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBP50607 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBP50607 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBP50607 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBP50607 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBP50607 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBP50607 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBP50607 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBP50607 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBP50607 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBP50607 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBP50607 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBP50607 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBP50607 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms