Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA1P49639 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA1P49639 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms