Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMAN1P49257 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN1P49257 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN1P49257 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms