Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDIT3P35638 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDIT3P35638 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms