Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A4P31645 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A4P31645 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms