Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC27P30260 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC27P30260 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC27P30260 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC27P30260 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC27P30260 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDC27P30260 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDC27P30260 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDC27P30260 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDC27P30260 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDC27P30260 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDC27P30260 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDC27P30260 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC27P30260 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC27P30260 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC27P30260 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC27P30260 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC27P30260 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC27P30260 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC27P30260 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC27P30260 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC27P30260 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC27P30260 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms