Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD40LGP29965 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD40LGP29965 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms