Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCHP24723 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCHP24723 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms