Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM225BP0DP42 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms