Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC175P0C221 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC175P0C221 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC175P0C221 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms